危危岛的解密核心在于元素方碑的激活顺序与仙灵引导的配合。首先需要在山顶区域找到初始仙灵并跟随其移动路径，仙灵会点亮第一处石柱作为提示。根据仙灵停留的位置，可以判断后续元素方碑的正确激活顺序为冰、风、火、水。其中冰与风元素方碑位于地面层，操作相对简单；火与水元素方碑需要调整至特定位置，火方碑需对准红色与绿色圆框标记方向后使用羽球击打激活。
完成全部元素方碑激活后，空中会出现类似马斯克礁的传送隧道，需击败周围刷新的敌人并拾取风精灵进入隧道。隧道内部存在隐藏宝箱与后续解密环节，需注意部分区域需要特定元素角色破解机关。危危岛的解密机制具有时空转换特性，部分机关需要在过去与现在两种时空状态下分别操作，通过水占镜装置可切换时空状态以完成对应步骤。
星光凝核的收集是解密过程中的关键环节，全岛共分布8个星光凝核。其中3个用于开启初始星空道路，剩余5个需在完成基础解密后获取。最复杂的凝核位于悬浮建筑顶部，需借助风场与风车机关上升至高空。所有凝核集齐后可在遗迹顶层交付，触发流星雨事件并解锁最终宝箱。部分凝核需要先完成世界任务正因其徒劳才能显现，该任务要求玩家在废墟内寻找星象图案并连接对应机关。
危危岛解密包含多个隐藏支线，如墙上的符号解密需要记录现在模式下墙壁显示的三个发光符号，返回过去模式后精确点亮对应符号才能解锁宝箱。羽球解密环节需调整风环角度使羽球通过特定路径，最远的风环应旋转至左侧方向。建议携带具有范围火伤能力的角色如班尼特，可简化部分火炬点亮流程。解密全程需保持对地形高度的敏感性，部分宝箱位于水下倒影或悬浮平台等非常规位置。
